Северное сельское поселение расположено в северо-западной части Шегарского района Томской области. Территория Северного поселения составляет 163,618 км2.
На севере поселение граничит с Кривошеинским районом Томской области, на западе – с Бакчарским районом, на востоке – с Трубачевским сельским поселением, на юго-западе – с Анастасьевским сельским поселением, на юге – с Шегарским сельским поселением.
Через поселение проходит автотрасса областного значения Томск–Колпашево.
Географическое положение Северного поселения можно охарактеризовать как достаточно выгодное с точки зрения круглогодичной транспортной доступности. Расстояние от населенных пунктов поселения до районного центра (с.Мельниково) в среднем составляет 63 км (от 43 до 77 км), до областного центра (г.Томск) – 127 км, что не способствует интенсивному развитию межмуниципального сотрудничества и экономической деятельности.
Однако в целом, учитывая хорошую транспортную доступность, такое географическое положение можно использовать для развития кооперативных и торгово-экономических связей.